في حالات السل الأولية، عادةً ما تكون الآفة موضعية في العقد اللمفاوية والرئتين وغشاء الجنب، وأحيانًا في أعضاء أخرى: الكلى والمفاصل والعظام والصفاق. قد تكون منطقة الالتهاب المحددة صغيرة جدًا وتظل مخفية أثناء الفحص. إذا كانت الآفة كبيرة، فعادةً ما يتم اكتشافها أثناء الفحص السريري والإشعاعي للمريض.