غالبًا ما تحدث ناسورات الجهاز البولي التناسلي نتيجةً لصدمة في الجهاز البولي في عيادات طب التوليد وأمراض النساء. في الدول النامية (مثل أفريقيا)، تُعد ناسورات الجهاز البولي التناسلي التوليدية أكثر شيوعًا.
بسبب ارتفاع معدل انتشار أمراض القولون، فضلاً عن زيادة عدد العمليات الجراحية المفتوحة والمنظارية على البروستاتا والمثانة، فإن الناسور الحالبي هو الأكثر شيوعًا.
تحدث الناسور بعد العلاج الإشعاعي، أو الناسور ما بعد الإشعاع، نتيجة تجاوز الحمل الإشعاعي المسموح به، وعدم مراعاة الفواصل الزمنية بين الجلسات، واضطراب الأوعية الدموية في أعضاء الجهاز البولي التناسلي، وكذلك زيادة حساسية الفرد للأشعة المؤينة.
غالبًا ما تصاحب الإصابات المفتوحة للقضيب إصابات في أعضاء أخرى، بما في ذلك الجهاز البولي التناسلي. تحدث الإصابات المفتوحة للقضيب لدى الأطفال غالبًا عند اللعب بأدوات حادة أو السقوط عليها.
في ثلث الحالات، تُلحق جميع جروح طلقات الرصاص في القضيب ضررًا بالأعضاء التناسلية الخارجية. وفي هذه الجروح، قد يُلحق الضرر بالإحليل، وكيس الصفن، والخصيتين، والفخذين، والعظام، وأعضاء الحوض، بالإضافة إلى الأجسام الكهفية.
تشكل الأضرار والإصابات التي تلحق بالقضيب ما نسبته 50% من إجمالي الأضرار والإصابات التي تلحق بالأعضاء التناسلية الخارجية، والتي تشكل ما نسبته 30-50% من إجمالي الإصابات التي تلحق بالجهاز البولي التناسلي.
تحدث الإصابات المفتوحة الناتجة عن الطعنات والصدمات في البروستاتا والحويصلات المنوية في الظروف المنزلية أو الصناعية أو القتالية عندما يتم إدخال أشياء حادة وثاقبة من خلال العجان أو المستقيم.
قد تحدث إصابات ورضوض مغلقة في البروستاتا والحويصلات المنوية نتيجة كسور في عظام الحوض، أو ضربة قوية على العجان، أو السقوط عليه. وعادةً ما تصاحب الكدمات والتمزقات في هذه الأعضاء تلف في الضفيرة الوريدية المجاورة.