السبب الرئيسي لتلف الغشاء المخاطي للفم والبلعوم هو العدوى. مع ذلك، تجدر الإشارة إلى أن التهاب الحلق قد ينجم أيضًا عن عوامل غير معدية، مثل: التلف الميكانيكي، والتعرض لدخان التبغ، واستنشاق الهواء الملوث أو شديد البرودة، وإجهاد الصوت، ودخول جسم غريب في الحلق، وإصابة الحلق، بالإضافة إلى أمراض أعضاء وأجهزة أخرى.
