بعض أنواع التهاب الكبد المناعي الذاتي ليس لها سبب محدد بوضوح، في حين أن البعض الآخر يرتبط بعوامل معروفة مثل حمض الثيينيك (مدر للبول) أو بأمراض مثل التهاب الكبد C و D. بشكل عام، يتميز التهاب الكبد المناعي الذاتي ذو السبب غير المعروف بصورة سريرية أكثر دراماتيكية، مع نشاط أعلى لإنزيمات الترانساميناز في المصل ومستويات غاما غلوبولين، وتشير أنسجة الكبد إلى نشاط أعلى من الحالات ذات السبب المعروف، واستجابة أفضل للعلاج بالكورتيكوستيرويد.
