تشمل عواقب نقص اللمفاويات الإصابة بالعدوى الانتهازية وزيادة خطر الإصابة بالسرطان وأمراض المناعة الذاتية. في حال اكتشاف نقص اللمفاويات أثناء فحص تعداد الدم الكامل، يلزم إجراء فحوصات تشخيصية لحالات نقص المناعة وتحليل مجموعات فرعية من الخلايا اللمفاوية. ويهدف العلاج إلى معالجة المرض الكامن.