تُقسّم جميع البروبيوتيك إلى عدة مجموعات بناءً على تصنيفها. قد يحتوي البروبيوتيك الواحد على عدة مكونات، وفي هذا الصدد، تُميّز المستحضرات أحادية المكون، التي تحتوي على نوع واحد فقط من البكتيريا. هذه الكائنات الدقيقة مفيدة بلا شك للأمعاء، وخاصةً للنباتات الدقيقة.