تعتمد موثوقية نتائج فحص الأمعاء، في المقام الأول، على التحضير الصحيح للأمعاء لهذا الإجراء. تشمل طرق فحص الأمعاء تنظير القولون الليفي، وتنظير المستقيم، وتنظير الري.
يُستخدم التنظير بالأشعة السينية لإجراء فحص دقيق ومفصل للأمعاء. لا تُناسب الأشعة السينية التقليدية هذا الإجراء دائمًا، نظرًا لصعوبة رؤية الأمعاء على خلفية الأعضاء والأنسجة المحيطة بها، فهي ليست معتمة للأشعة السينية.