يُمثَّل جينوم فيروس التهاب الكبد الوبائي سي بحمض نووي ريبوزي أحادي السلسلة موجب الشحنة، يُشفِّر ثلاثة بروتينات هيكلية (نواة بروتين الغلاف النووي والبروتينات النووية للغلاف E1-E2) وخمسة بروتينات هيكلية (NS1، NS2، NS3، NS4، NS5). تُصنَّع الأجسام المضادة لكلٍّ من هذه البروتينات، الموجودة في دم مرضى التهاب الكبد الفيروسي سي.