يوجد في أمعاء الشخص السليم توازنٌ مُعين بين الكائنات الدقيقة التي تعيش فيها. الغالبية العظمى من البكتيريا (99%) هي مُمثلاتٌ مفيدةٌ للميكروفلورا المعوية، وهي: بكتيريا البيفيدوباكتيريا، والباكتيرويدات، والعصيات اللبنية، والإشريكية القولونية، والمكورات المعوية.